百度飞桨仰仗图进修框架（PGL）和生物筹算平台螺旋桨（PaddleHelix），飞桨分性登顶权力巨擘榜单 OGB 多项分子性原料想义务
，更始在 AI 药物创作创造局限掉落踪掉落踪新的原料I药技能打破
。

合物的想榜生物活性遴选是现代药物研发中关头的一环
 ，其次要方针是单助在除夜量候选化合物中创作创造针对某种药物靶点具有活性的分子。传统的物研活性遴选编制需求分化除夜量化合物用以举办生物考验考验  ，全数流程的飞桨分性成本高 、周期长 、更始成功率低。原料I药而经由过程 AI 技能举办药物的想榜虚构遴选有看庖代传统的活性遴选编制，加快中心法度圭表类型从而除夜幅度降低研发成本 。单助

国际权力巨擘榜单 Open Graph Benchmark（OGB）上的物研 HIV 和 PCBA 数据集包含多种生物活性考验考验 。个中 ，飞桨分性HIV 数据集存眷不合化合物可否可以阻拦 HIV 病毒在细胞内的更始复制，PCBA 数据集存眷不合化合物针对100多种疾病靶点的原料I药有效性 。以个中能加强下场性 SMN2 蛋白表达的化合物为例 ，这些化合物可以改进因 SMN1 蛋白渐变损掉落踪落效激起的脊髓肌肉萎缩。成功料想化合物这类性质对创作创造针对多种疾病的有效药物具有次要意义 。

不日 ，飞桨在 OGB 该两项分子性原料想榜单登上榜首 ，在 AI 药物创作创造局限掉落踪掉落踪了新的技能打破 。

基于飞桨身手完成分子性原料想

飞桨基于图进修框架 PGL  ，独霸深度图神经群集（GNN），合餬口物筹算平台螺旋桨 PaddleHelix 对药物创作创造局限的邃晓，筹划自拒守进修义务进修化合物分子展示，并独霸到分子性原意估中。中心技能包含
  ：

分子展示进修 

为了将化合物分子作为图神经群团编制的输进，需求起首将化合物分子特点化。OGB 已针对每个化合物供给了一系列基于图筹划的结点和边的特点 ，可以对应到化合物的原子和化学键，但这些特点都较为微不美不雅不雅不雅不雅不雅不雅 ，没法展示化合物分子的宏不美不雅不雅不雅不雅不雅不雅化学特点。飞桨经由过程展示进修的编制，初度将分子的宏不美不雅不雅不雅不雅不雅不雅化学特点（官能团
、分子指纹等信息）和图神经群集相连络 ，掉落踪掉落踪了迟滞融合宏不美不雅不雅不雅不雅不雅不雅化学特点的分子展示 ，并独霸这个分子展示掉落踪掉落踪了 ogbg-molhiv 的榜首。

 图进修技能 

APPNP 是基于赋性化 PageRank 改进的特点撒播算法 ，经由过程迭代的编制来近似 Personal PageRank 的分析。APPNP 算法不引进出格的模型参数 ，可以很好地调剂部分信息和多阶邻居相干 。飞桨经由过程连络 GINE plus 和 APPNP 技能，在不引进出格的模型参数下 ，掉落踪掉落踪更好的模型表达身手
，并掉落踪掉落踪 ogbg-molpcba 榜首。

飞桨图进修框架 PGL 

百度深度进修平台飞桨 PaddlePaddle 开源图进修框架 PGL v2.0 版本，单方面支撑静态图机制 ，可支撑百亿局限除夜图，用户可以经由过程 PGL 完成高效而又知足财富独霸需求的图神经群集
。PGL 支撑的百度表里部营业也是遍地开花 ，单方面袒护推荐琐细、搜刮引擎、机警金融 、智能地图、安然风控、生物医药等场景 。

 生物筹算螺旋桨 PaddleHelix 

螺旋桨 PaddleHelix 是基于百度深度进修平台飞桨的生物筹算平台 。供给了包含 RNA 二级筹划料想 、除夜局限分子和蛋白质展示进修、药物靶点亲和力料想 、 ADMET 成药性料想等，在新药研发和疫苗筹划环节具有坦荡宽大年夜大年夜奔放宽除夜广大年夜奔放独霸前景的技能身手 。

螺旋桨 PaddleHelix 可以辅佐生物学 、药物化学 、筹算机交错学科布景的进修者、研究者和合作火伴更便外埠构建 AI 算法模型。螺旋桨 PaddleHelix 生物筹算平台将贯穿连接开源开放绳尺，与合作火伴共建共享，将来构成一套无缺的面向行业的生物筹算生态和处事。

想掉落踪掉落踪更多算法的技能细节
，迎接存眷 PGL 和 PaddleHelix，比赛相干代码已同步开放。

PGL 代码链接：

http://github.com/PaddlePaddle/PGL

PaddleHelix 代码链接 ：

http://github.com/PaddlePaddle/PaddleHelix